More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1286 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  75.96 
 
 
788 aa  1208    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  71.85 
 
 
796 aa  1170    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  77.5 
 
 
792 aa  1276    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  42.75 
 
 
752 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  75.93 
 
 
795 aa  1217    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  70.64 
 
 
792 aa  1153    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  63.75 
 
 
756 aa  976    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  78.21 
 
 
790 aa  1266    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  69.31 
 
 
799 aa  1081    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  77.59 
 
 
790 aa  1267    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  75.86 
 
 
805 aa  1219    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  49.68 
 
 
750 aa  755    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  77.3 
 
 
794 aa  1260    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
752 aa  730    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  50.97 
 
 
752 aa  698    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  67.05 
 
 
754 aa  1061    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  46.21 
 
 
754 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  80.95 
 
 
795 aa  1276    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  51.74 
 
 
790 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  100 
 
 
827 aa  1687    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  75.93 
 
 
796 aa  1187    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  75.48 
 
 
790 aa  1184    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  73.69 
 
 
797 aa  1188    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  77.82 
 
 
826 aa  1269    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  46.9 
 
 
745 aa  747    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  75.22 
 
 
793 aa  1185    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  49.61 
 
 
751 aa  780    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  48.85 
 
 
753 aa  769    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  76.85 
 
 
810 aa  1255    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  56.78 
 
 
798 aa  904    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  76.53 
 
 
795 aa  1203    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  46.07 
 
 
761 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  43.61 
 
 
760 aa  672    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  75.03 
 
 
799 aa  1208    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  75.09 
 
 
794 aa  1220    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  72.89 
 
 
795 aa  1177    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  75.22 
 
 
793 aa  1185    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  73.51 
 
 
792 aa  1172    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  69.9 
 
 
798 aa  1133    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  45.88 
 
 
761 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  49.81 
 
 
780 aa  776    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  75.22 
 
 
793 aa  1183    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  75.25 
 
 
797 aa  1222    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  78.52 
 
 
801 aa  1237    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  49.41 
 
 
745 aa  766    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  77.51 
 
 
798 aa  1239    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  78.64 
 
 
768 aa  1244    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  51.03 
 
 
758 aa  755    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  74.58 
 
 
797 aa  1198    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
752 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  41.03 
 
 
750 aa  596  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  70.03 
 
 
402 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.24 
 
 
844 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.51 
 
 
843 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.2 
 
 
820 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.4 
 
 
823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.13 
 
 
850 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  39.93 
 
 
776 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  37.17 
 
 
848 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  37.06 
 
 
848 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  37.06 
 
 
848 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.39 
 
 
853 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.62 
 
 
827 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  36.61 
 
 
860 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  35.89 
 
 
843 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.7 
 
 
838 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.38 
 
 
822 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.7 
 
 
838 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  34.63 
 
 
834 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.11 
 
 
877 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  39.1 
 
 
947 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  34.62 
 
 
838 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  38.14 
 
 
973 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.46 
 
 
861 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.27 
 
 
832 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  35.24 
 
 
863 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  37.52 
 
 
939 aa  431  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  34.78 
 
 
894 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.38 
 
 
927 aa  429  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1559  putative uvrA-like protein  81.42 
 
 
253 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0605734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3553  excinuclease ABC, A subunit  37.11 
 
 
935 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  40.36 
 
 
962 aa  425  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  35.42 
 
 
939 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  39.59 
 
 
963 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.1 
 
 
942 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  36.47 
 
 
824 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  39.26 
 
 
947 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  39.49 
 
 
956 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  38.96 
 
 
947 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  35.42 
 
 
939 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.19 
 
 
898 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  39.91 
 
 
946 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  39.76 
 
 
947 aa  422  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  40.09 
 
 
957 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  36.99 
 
 
833 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3337  excinuclease ABC, A subunit  39.39 
 
 
1008 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690978  normal  0.507312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3848  excinuclease ABC, A subunit  38.76 
 
 
975 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00424286  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04893  excinuclease ABC subunit A  36.63 
 
 
988 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000582008  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  37.07 
 
 
920 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  33.82 
 
 
950 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>