More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0885 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 752 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  47.8 
 
 		 745 aa  707    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  48.94 
 
 		 752 aa  718    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  44.43 
 
 		 780 aa  679    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 756 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  44.03 
 
 		 761 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  48.93 
 
 		 752 aa  708    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  48.53 
 
 		 758 aa  698    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 752 aa  652    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  48 
 
 		 753 aa  742    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  44.16 
 
 		 761 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  46.83 
 
 		 751 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  50.6 
 
 		 760 aa  781    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  45.59 
 
 		 750 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  100 
 
 		 750 aa  1542    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  46.15 
 
 		 745 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  46.87 
 
 		 754 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  43.22 
 
 		 754 aa  630  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  42.61 
 
 		 790 aa  625  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 		 790 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 792 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  41.73 
 
 		 795 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 790 aa  612  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  41.89 
 
 		 794 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  40.76 
 
 		 792 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  40.61 
 
 		 796 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 798 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 794 aa  605  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  40.28 
 
 		 810 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  40.08 
 
 		 795 aa  601  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  42.89 
 
 		 796 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  41.93 
 
 		 768 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  41.99 
 
 		 792 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 827 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  40.28 
 
 		 798 aa  591  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 788 aa  591  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  40.87 
 
 		 801 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 795 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  42.11 
 
 		 793 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  40.33 
 
 		 797 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  42.11 
 
 		 793 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  39.8 
 
 		 799 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 799 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  41.73 
 
 		 793 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 790 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  39.01 
 
 		 798 aa  578  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  41.63 
 
 		 797 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  41.25 
 
 		 797 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  40.85 
 
 		 795 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  40.94 
 
 		 826 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.53 
 
 		 832 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  36.23 
 
 		 834 aa  492  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.47 
 
 		 853 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  34.05 
 
 		 838 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.14 
 
 		 844 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.19 
 
 		 843 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  34.64 
 
 		 850 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  33.1 
 
 		 838 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  33.37 
 
 		 838 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  33.11 
 
 		 897 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  33.17 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  32.45 
 
 		 877 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  32.58 
 
 		 950 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  33.18 
 
 		 894 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  32.55 
 
 		 899 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.16 
 
 		 822 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.05 
 
 		 860 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  33.37 
 
 		 827 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.75 
 
 		 954 aa  456  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  33.57 
 
 		 838 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  39.89 
 
 		 954 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  33.05 
 
 		 848 aa  459  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  36.11 
 
 		 776 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  33.05 
 
 		 848 aa  459  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  35.57 
 
 		 851 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  33.05 
 
 		 848 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  34.09 
 
 		 823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  32.73 
 
 		 885 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  38.68 
 
 		 951 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  38.57 
 
 		 954 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.32 
 
 		 931 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  32.08 
 
 		 843 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.26 
 
 		 939 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  38.11 
 
 		 939 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0451  excinuclease ABC subunit A  38.46 
 
 		 951 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0853  excinuclease ABC subunit A  38.47 
 
 		 954 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  33.02 
 
 		 863 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  31.47 
 
 		 898 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0427  excinuclease ABC subunit A  38.32 
 
 		 951 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  38.37 
 
 		 938 aa  445  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  40.53 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  32.02 
 
 		 820 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  40.6 
 
 		 916 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  31.85 
 
 		 899 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  31.93 
 
 		 898 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  37.84 
 
 		 942 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  33.64 
 
 		 881 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0324  excinuclease ABC, A subunit  39.51 
 
 		 935 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  37.23 
 
 		 954 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>