More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2761 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  48.34 
 
 
796 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  58.67 
 
 
750 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  55.12 
 
 
745 aa  853    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  43.22 
 
 
752 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  48.54 
 
 
799 aa  680    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  47.63 
 
 
795 aa  685    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  48.52 
 
 
796 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  49.87 
 
 
792 aa  739    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  49.37 
 
 
799 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
790 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  51.02 
 
 
810 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  52.49 
 
 
752 aa  743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  54.19 
 
 
790 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  48.85 
 
 
790 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  50.19 
 
 
797 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  56.51 
 
 
751 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  49.06 
 
 
754 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  50.7 
 
 
826 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
788 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  51.39 
 
 
768 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  49.23 
 
 
797 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
798 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  48.59 
 
 
801 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  49.11 
 
 
793 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  48.53 
 
 
798 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  100 
 
 
752 aa  1536    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
827 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  53.87 
 
 
745 aa  833    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  52.21 
 
 
761 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  52.21 
 
 
761 aa  753    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  44.87 
 
 
760 aa  677    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  52.06 
 
 
753 aa  809    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  43.64 
 
 
750 aa  648    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
752 aa  657    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  47.63 
 
 
798 aa  677    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  49.87 
 
 
794 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  52.41 
 
 
756 aa  744    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  57.73 
 
 
758 aa  855    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  48.65 
 
 
795 aa  715    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  49.11 
 
 
793 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 
792 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  48.97 
 
 
795 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  50.32 
 
 
805 aa  739    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
794 aa  717    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  54.81 
 
 
754 aa  790    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  48.52 
 
 
792 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  50 
 
 
790 aa  705    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  48.85 
 
 
793 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
795 aa  707    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  55.11 
 
 
780 aa  860    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  48.91 
 
 
797 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  36.01 
 
 
823 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  37.92 
 
 
843 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  36.87 
 
 
820 aa  492  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  37.31 
 
 
838 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  38.01 
 
 
850 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  38.16 
 
 
844 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  41.67 
 
 
946 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  40 
 
 
941 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  41.39 
 
 
941 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  36.44 
 
 
853 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  41.64 
 
 
942 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  37.03 
 
 
861 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  41.42 
 
 
947 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.62 
 
 
838 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18501  excinuclease ABC subunit A  39.6 
 
 
979 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95453  normal  0.0541711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  39.59 
 
 
947 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  42.75 
 
 
945 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.97 
 
 
832 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  39.74 
 
 
947 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  40.59 
 
 
942 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2882  excinuclease ABC, A subunit  40.06 
 
 
964 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1323  excinuclease ABC subunit A  38.81 
 
 
980 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2691  excinuclease ABC subunit A  39.48 
 
 
987 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  40.87 
 
 
946 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.35 
 
 
838 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21961  excinuclease ABC subunit A  38.81 
 
 
980 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  36.29 
 
 
834 aa  462  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0704  excinuclease ABC, A subunit  39.97 
 
 
939 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0087  excinuclease ABC, A subunit  40.18 
 
 
937 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  39.68 
 
 
962 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0774  excinuclease ABC, A subunit  37.79 
 
 
946 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.8 
 
 
942 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.27 
 
 
939 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  35.61 
 
 
818 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1525  excinuclease ABC subunit A  40.83 
 
 
925 aa  458  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.85 
 
 
827 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  37.02 
 
 
894 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  37.87 
 
 
939 aa  457  1e-127  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  37.38 
 
 
822 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.98 
 
 
939 aa  459  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  40.06 
 
 
936 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  42.67 
 
 
947 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1010  excinuclease ABC subunit A  39.85 
 
 
954 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  40.9 
 
 
945 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2317  excinuclease ABC subunit A  40.17 
 
 
976 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.458787  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  37.23 
 
 
945 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.39 
 
 
950 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  39.26 
 
 
931 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1015  excinuclease ABC subunit A  40.15 
 
 
977 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.198775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>