More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3885 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  100 
 
 		 609 aa  1229    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  49.65 
 
 		 603 aa  536  1e-151  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  51.69 
 
 		 599 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  47.08 
 
 		 584 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  48.52 
 
 		 605 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  46.78 
 
 		 586 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  48.09 
 
 		 582 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  48.47 
 
 		 586 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  49.1 
 
 		 582 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  47.74 
 
 		 582 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  48.56 
 
 		 582 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  48.56 
 
 		 582 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  48.5 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  46.93 
 
 		 606 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  39 
 
 		 608 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  45.76 
 
 		 598 aa  344  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  37.6 
 
 		 597 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.52 
 
 		 502 aa  321  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  39.49 
 
 		 588 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  36.08 
 
 		 925 aa  318  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  35.14 
 
 		 637 aa  309  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  35.22 
 
 		 1005 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  36.08 
 
 		 925 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  36.76 
 
 		 1004 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  33.88 
 
 		 650 aa  301  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  40.87 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  36.01 
 
 		 631 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.04 
 
 		 616 aa  296  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  34.71 
 
 		 616 aa  293  8e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  35.89 
 
 		 926 aa  293  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  35.7 
 
 		 957 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  38.46 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  41.77 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  41.25 
 
 		 515 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  41.56 
 
 		 515 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  37.15 
 
 		 483 aa  287  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  41.15 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  35.68 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  38.91 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  39.87 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.87 
 
 		 596 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  37.64 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  38.05 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  39.49 
 
 		 591 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  37.75 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  35.91 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  38.88 
 
 		 589 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  35.7 
 
 		 517 aa  267  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  37.03 
 
 		 598 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 457 aa  266  8e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  38.68 
 
 		 593 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  39.69 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  39.25 
 
 		 596 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  39.69 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  40.35 
 
 		 596 aa  262  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  37.14 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  39.69 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  34.19 
 
 		 517 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.55 
 
 		 519 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.78 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  35.85 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  39.47 
 
 		 597 aa  257  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  37.83 
 
 		 464 aa  254  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  37.26 
 
 		 511 aa  253  8.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  34.32 
 
 		 519 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  35.2 
 
 		 515 aa  252  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  37.42 
 
 		 511 aa  250  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.27 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  34.55 
 
 		 506 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.91 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  34.53 
 
 		 506 aa  242  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  34.19 
 
 		 506 aa  241  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.14 
 
 		 577 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  34.19 
 
 		 506 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  34.26 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  34.85 
 
 		 506 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  34.27 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  33.48 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  34.24 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.55 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  35.34 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  36.02 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  32.64 
 
 		 518 aa  211  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  31.36 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  34.36 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  32.24 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  32.16 
 
 		 505 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.59 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  31.82 
 
 		 481 aa  200  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  30.7 
 
 		 507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  32.44 
 
 		 500 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  31.38 
 
 		 668 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  32.26 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  30.84 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  30.17 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>