More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0845 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 		 740 aa  1536    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  38.48 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  36.42 
 
 		 502 aa  248  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1834  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 504 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0259899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4728  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4129  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 504 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.60213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.29 
 
 		 501 aa  157  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1329  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  27.47 
 
 		 512 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  27.26 
 
 		 512 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  25.42 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.66 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.29 
 
 		 544 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  24.39 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.99 
 
 		 508 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.81 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  25.97 
 
 		 504 aa  137  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.43 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  26.26 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 532 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  25.29 
 
 		 506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  24.33 
 
 		 518 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.1 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  27.6 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23 
 
 		 520 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  27.03 
 
 		 509 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  25.57 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 506 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  25.57 
 
 		 499 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  26.86 
 
 		 503 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 510 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  26.13 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  23.56 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.96 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 534 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 547 aa  114  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.98 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.29 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 503 aa  110  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.78 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  25.19 
 
 		 505 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 497 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  24.72 
 
 		 509 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  24.95 
 
 		 595 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  23.24 
 
 		 535 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 484 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.07 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.73 
 
 		 523 aa  103  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  26.63 
 
 		 598 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.38 
 
 		 938 aa  100  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 717 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 510 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.8 
 
 		 522 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.17 
 
 		 242 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  26.25 
 
 		 523 aa  98.6  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.89 
 
 		 505 aa  98.6  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  25.34 
 
 		 507 aa  97.8  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.44 
 
 		 586 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.02 
 
 		 232 aa  97.8  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.78 
 
 		 511 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.53 
 
 		 505 aa  97.8  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.6 
 
 		 503 aa  97.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.63 
 
 		 562 aa  97.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  24.31 
 
 		 510 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  23.02 
 
 		 494 aa  96.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  24.25 
 
 		 511 aa  95.5  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 515 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.35 
 
 		 511 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.64 
 
 		 501 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.76 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 500 aa  93.2  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.45 
 
 		 232 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 520 aa  91.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  23.87 
 
 		 509 aa  90.9  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  27.01 
 
 		 232 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  24.71 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.07 
 
 		 507 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  23.79 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.57 
 
 		 509 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  25.05 
 
 		 530 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  23.77 
 
 		 708 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1593  putative ferredoxin NAD(+) reductase  29.17 
 
 		 332 aa  89  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655318  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 722 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.61 
 
 		 492 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.66 
 
 		 518 aa  87.8  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  25.29 
 
 		 504 aa  87.8  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.24 
 
 		 505 aa  87.4  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  23 
 
 		 503 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  24.52 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  23.87 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  23.32 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.25 
 
 		 711 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  23.22 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.62 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>