More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0707 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0707  30S ribosomal protein S5P  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0239134  hitchhiker  0.000000000105394 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1306  30S ribosomal protein S5P  73.23 
 
 		 202 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.244204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0313  30S ribosomal protein S5P  71.65 
 
 		 197 aa  300  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0779  30S ribosomal protein S5P  69.19 
 
 		 202 aa  295  4e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1206  30S ribosomal protein S5P  69.07 
 
 		 202 aa  294  7e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.359791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0236  30S ribosomal protein S5P  69.95 
 
 		 202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1758  ribosomal protein S5  64.68 
 
 		 214 aa  271  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0769972  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0111  30S ribosomal protein S5P  63.18 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  unclonable  0.000000379651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2233  30S ribosomal protein S5P  54.5 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0588103  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1501  ribosomal protein S5  54.87 
 
 		 217 aa  228  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000598277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0159  30S ribosomal protein S5P  53.65 
 
 		 229 aa  227  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0020988  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1254  30S ribosomal protein S5P  53.65 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0153949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0664  30S ribosomal protein S5P  53.65 
 
 		 229 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00751538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0462  30S ribosomal protein S5P  55.38 
 
 		 207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.599903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1404  30S ribosomal protein S5P  51.04 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0584  30S ribosomal protein S5P  54.08 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1708  30S ribosomal protein S5P  52.36 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0552  30S ribosomal protein S5P  53.61 
 
 		 205 aa  215  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.897256  normal  0.326676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0090  30S ribosomal protein S5P  50 
 
 		 208 aa  214  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00484292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0021  30S ribosomal protein S5P  53.93 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000032462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2312  30S ribosomal protein S5P  51.85 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0101  30S ribosomal protein S5P  52.55 
 
 		 205 aa  207  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.827506 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0730  30S ribosomal protein S5P  51.56 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1848  30S ribosomal protein S5P  50.26 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2238  ribosomal protein S5  50.52 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0230  ribosomal protein S5  50 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0864228  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0399  30S ribosomal protein S5P  47.37 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0467584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2429  30S ribosomal protein S5P  47.87 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04150  ribosomal protein S2, putative  46.15 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18532  Cytosolic 80S ribosomal protein S2; Cytosolic 40S small ribosomal subunit protein S2  44.04 
 
 		 273 aa  168  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00101869  normal  0.0391039 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48411  predicted protein  43.98 
 
 		 264 aa  160  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74777  40S ribosomal protein S2 (S4) (YS5) (RP12) (Omnipotent suppressor protein SUP44)  44.27 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518676  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03413  ribosomal protein S5 (AFU_orthologue; AFUA_7G01460)  42.78 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32264  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1377  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0423058  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1309  30S ribosomal protein S5  40 
 
 		 178 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  38.36 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  36.67 
 
 		 165 aa  85.9  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1121  30S ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 176 aa  85.5  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.421143  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  31.58 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 166 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  34.42 
 
 		 165 aa  84.7  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  34.42 
 
 		 165 aa  84.7  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  34.21 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0618  30S ribosomal protein S5  30.41 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.442649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  30.67 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0773  30S ribosomal protein S5  33.11 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  34.87 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0233  30S ribosomal protein S5  33.99 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.86106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0236  30S ribosomal protein S5  33.99 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  35.37 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  35.66 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  35.85 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1634  30S ribosomal protein S5  35.14 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  32.72 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  38.96 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16621  30S ribosomal protein S5  35.14 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  35.53 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0390  30S ribosomal protein S5  29.05 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  33.12 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1039  30S ribosomal protein S5  29.73 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  35.06 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  32.34 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  37.24 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0398  30S ribosomal protein S5  29.05 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0506  30S ribosomal protein S5  30.67 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  33.56 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0501  30S ribosomal protein S5  30.67 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000846661  normal  0.0709882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  36.81 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17331  30S ribosomal protein S5  35.14 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1971  30S ribosomal protein S5  34.23 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8413  predicted protein  32.39 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23191  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  32.05 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  37.24 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1113  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.7604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0360  30S ribosomal protein S5  35.46 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  29.45 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  34.01 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19871  30S ribosomal protein S5  34.67 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  34.23 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  31.51 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  30.82 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17241  30S ribosomal protein S5  34.46 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>