More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0274 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0274  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.129476  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0282  30S ribosomal protein S5  53.97 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  52.54 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 166 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  54.27 
 
 		 166 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  52.8 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  56.6 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  52.47 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  51.53 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  52.5 
 
 		 162 aa  164  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  50.62 
 
 		 168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 162 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  52.44 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3932  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  50.96 
 
 		 167 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  53.64 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  53.16 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  51.83 
 
 		 172 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  49.07 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  49.38 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  50.31 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 169 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2157  30S ribosomal protein S5  48.82 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  51.88 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  49.04 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  51.59 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  52.47 
 
 		 166 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  52.12 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 168 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  48.82 
 
 		 167 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000199413  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  55.19 
 
 		 165 aa  158  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  54.3 
 
 		 166 aa  158  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  50.97 
 
 		 172 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  54.25 
 
 		 210 aa  157  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  48.82 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  50.32 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  52.98 
 
 		 163 aa  157  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4781  30S ribosomal protein S5  51.25 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694187  hitchhiker  0.00000059117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  49.68 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 166 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  48.77 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  48.41 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  54.25 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  54.14 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0077  30S ribosomal protein S5  52.35 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0793538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  47.77 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  52.8 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  53.01 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  48.8 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  48.15 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  49.03 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 168 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  54.25 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3734  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000123332  decreased coverage  0.00107093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  52.38 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  46.15 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2147  30S ribosomal protein S5  51.57 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  51.61 
 
 		 167 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>