123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1474 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  100 
 
 		 426 aa  883    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  61.61 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  49.53 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  46 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  45.06 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  43.03 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  41.98 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  39.62 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  38.68 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  40.15 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  39.24 
 
 		 433 aa  305  7e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  37.15 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  39.14 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  31.64 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.01 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.13 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  30.96 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  32.99 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.38 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.38 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  30.28 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.09 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.66 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.68 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.19 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.6 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  30.88 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  25.92 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  27.79 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.68 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  26.79 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.09 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  25.67 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  27.84 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.22 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  27.37 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  25.24 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.49 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  25.93 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  25.14 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  25.87 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.51 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  25.06 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  25.81 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  31.33 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  23.93 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  27.15 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  25.37 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  24.12 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  24.36 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.38 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.19 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.65 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.56 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.21 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.21 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  25.78 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  26.91 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  23.89 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  35.24 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.31 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  25.93 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  25.69 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  22.41 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.1 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  23.08 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  21.99 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  25.34 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  22.7 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  27.33 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  23.83 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  25.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  24.5 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.7 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.54 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  24.74 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  23.11 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  24.12 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  21.8 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  25.1 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.55 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  22.07 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  28.83 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  26.54 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.78 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  23.01 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  25.1 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  25.1 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  27.03 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  28.75 
 
 		 318 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  23.29 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>