More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1421 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  83.88 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  73.77 
 
 		 248 aa  374  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  75.32 
 
 		 244 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  77.49 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  71.86 
 
 		 245 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  68.1 
 
 		 254 aa  325  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  66.23 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  68 
 
 		 240 aa  311  9e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  64.94 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.2 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  61.8 
 
 		 234 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  63.56 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  63.11 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  63.79 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  62.23 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  61.47 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  62.67 
 
 		 251 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  62.23 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  62.22 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  58.33 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  59.91 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  58.8 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  58.8 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  59.74 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  59.66 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  58.8 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  61.67 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  55.08 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  64.35 
 
 		 250 aa  278  5e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  54.66 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  56.71 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  59.91 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  57.78 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  55.7 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  52.17 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  53.33 
 
 		 234 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  51.29 
 
 		 233 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  54.13 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  53.78 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.05 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  48.28 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  51.29 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  51.79 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  50.44 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  47.83 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.53 
 
 		 233 aa  238  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  47.46 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.14 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.52 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  49.15 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.03 
 
 		 604 aa  214  9e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.05 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.87 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.87 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.05 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  46.49 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.11 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.49 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  45.11 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.33 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  47.53 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.2 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.67 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.2 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  45.54 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  46.7 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.2 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.91 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  47.91 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  45.91 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  41.13 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.09 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.04 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  46.64 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.73 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  41.95 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  43.11 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  44.34 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.28 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 226 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>