240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0470 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0537  surface antigen (D15)  51.56 
 
 		 722 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0652  surface antigen (D15)  64.86 
 
 		 734 aa  957    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.496085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1648  hypothetical protein  59.37 
 
 		 725 aa  893    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0176  hypothetical protein  54.21 
 
 		 741 aa  824    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0492  surface antigen (D15)  52.34 
 
 		 761 aa  789    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0533  surface antigen (D15)  64.94 
 
 		 743 aa  996    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0470  surface antigen (D15)  100 
 
 		 730 aa  1489    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2555  surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 803 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0992  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 875 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1648  hypothetical protein  23.59 
 
 		 780 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0735  surface antigen (D15)  23.84 
 
 		 767 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000801153  hitchhiker  0.00000000000164396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2726  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 806 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 772 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1223  outer membrane protein  23.51 
 
 		 766 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.760862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1269  surface antigen (D15)  24.02 
 
 		 769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.743361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12263  hypothetical protein  22.75 
 
 		 853 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.167756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  23.37 
 
 		 858 aa  115  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  23.54 
 
 		 762 aa  112  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0980  hypothetical protein  24.95 
 
 		 745 aa  108  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 810 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3472  surface antigen (D15)  22.93 
 
 		 774 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.151472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  23.17 
 
 		 851 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1917  outer membrane protein  21.96 
 
 		 809 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.220726 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 775 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  23.33 
 
 		 808 aa  98.2  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3196  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 811 aa  97.8  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  31.68 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  20.45 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  20.8 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  30.91 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  23.41 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.37 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  31.64 
 
 		 835 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.68 
 
 		 791 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  29.8 
 
 		 607 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.73 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  31.3 
 
 		 752 aa  62.4  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  30.73 
 
 		 784 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  32.87 
 
 		 776 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.97 
 
 		 633 aa  62  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 		 787 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  33.9 
 
 		 612 aa  62  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  33.9 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.03 
 
 		 796 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.88 
 
 		 622 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.38 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2533  OMP85 family outer membrane protein  26.04 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.233275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  30.63 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.01 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 571 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  30.6 
 
 		 702 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.53 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  28.65 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  30 
 
 		 643 aa  57.4  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 820 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  26.62 
 
 		 677 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  21.64 
 
 		 674 aa  56.6  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  27.32 
 
 		 739 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  31.2 
 
 		 582 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  27.12 
 
 		 788 aa  55.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.36 
 
 		 797 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  34.78 
 
 		 573 aa  55.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1045 aa  54.7  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0260  surface antigen (D15)  27.49 
 
 		 579 aa  54.7  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  29.33 
 
 		 1126 aa  54.7  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.01 
 
 		 772 aa  54.3  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 1002 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.85 
 
 		 808 aa  53.9  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  29.63 
 
 		 821 aa  53.9  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 575 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  32.2 
 
 		 584 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  28.28 
 
 		 613 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  29.09 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  25.85 
 
 		 653 aa  53.9  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  30.77 
 
 		 577 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 768 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  29.53 
 
 		 577 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  29.53 
 
 		 577 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  29.53 
 
 		 577 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  30.07 
 
 		 657 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  28.02 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  29.53 
 
 		 577 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 768 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  25 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  28.07 
 
 		 596 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 677 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.68 
 
 		 574 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 580 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00779  hypothetical protein  30.15 
 
 		 570 aa  52.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  26.99 
 
 		 579 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  28.17 
 
 		 583 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  29.53 
 
 		 577 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 752 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.68 
 
 		 807 aa  52.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 769 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>