286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0987 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0987  membrane fusion component of efflux system  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.872539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0750  hypothetical protein  54.47 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1176  hypothetical protein  54.07 
 
 		 246 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0174847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1051  hypothetical protein  53.66 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1273  membrane fusion protein of the hefABC efflux system HefB  41.46 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0109811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0687  selenocysteine-specific elongation factor SelB  40.08 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.866215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0978  hypothetical protein  37.14 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1441  putative efflux transporter  33.76 
 
 		 250 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00742524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  23.3 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  22.73 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.27 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  22.91 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  24.55 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  26.84 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  25.11 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  23.26 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.52 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1475  secretion protein HlyD  21.33 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.89 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  22.27 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  25.84 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1316  secretion protein HlyD  20.65 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  20.09 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  23.75 
 
 		 405 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  23.18 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  22.16 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  20.09 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  23.48 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  17.04 
 
 		 472 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  21.79 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  21.28 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  27.61 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  17.04 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  17.04 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  19.52 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  21.43 
 
 		 367 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  20.18 
 
 		 419 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  21.26 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  27.69 
 
 		 384 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  21.33 
 
 		 409 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.18 
 
 		 455 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  24.03 
 
 		 403 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  22.84 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 361 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 407 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  23.35 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  22.3 
 
 		 380 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22 
 
 		 356 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000654  putative efflux protein  27.97 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.81 
 
 		 388 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  23.5 
 
 		 373 aa  52  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  20.31 
 
 		 398 aa  52  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 406 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 		 382 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.03 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  21.89 
 
 		 397 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 417 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  22.04 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.64 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.85 
 
 		 448 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.43 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  23.11 
 
 		 363 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  25.84 
 
 		 520 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  25.84 
 
 		 520 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 370 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  21.59 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  20.52 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  24.43 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  22.94 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  22.01 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20 
 
 		 397 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  21.13 
 
 		 365 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.48 
 
 		 346 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 380 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 		 392 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.48 
 
 		 346 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  22.27 
 
 		 359 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  21.91 
 
 		 363 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  25.39 
 
 		 366 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>