More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3368 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  100 
 
 		 734 aa  1456    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  41.71 
 
 		 809 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  38.4 
 
 		 700 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 716 aa  207  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  34.87 
 
 		 696 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  34.33 
 
 		 690 aa  191  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  33.83 
 
 		 699 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 706 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  33.81 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  33.27 
 
 		 659 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  28.43 
 
 		 705 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 737 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 703 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 703 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  28.25 
 
 		 704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.25 
 
 		 704 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  31.73 
 
 		 683 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  31.47 
 
 		 673 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.87 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  32.38 
 
 		 714 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  32.56 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  31.72 
 
 		 759 aa  160  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 752 aa  160  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 679 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 662 aa  152  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.06 
 
 		 711 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 821 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.05 
 
 		 737 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 		 685 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  37.74 
 
 		 465 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  30.89 
 
 		 687 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  29.58 
 
 		 695 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 697 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  24.04 
 
 		 819 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 710 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  30.35 
 
 		 712 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.82 
 
 		 815 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  29.85 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 695 aa  110  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.19 
 
 		 1107 aa  97.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  30.65 
 
 		 593 aa  94.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 		 671 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  30.62 
 
 		 632 aa  87.8  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  29.62 
 
 		 619 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.89 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  26.48 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  30.12 
 
 		 615 aa  84  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  31.5 
 
 		 619 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  23.28 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.05 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.79 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  28.06 
 
 		 613 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.06 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.4 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  23.17 
 
 		 738 aa  78.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.36 
 
 		 830 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  23.4 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.11 
 
 		 932 aa  77.8  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  27.13 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 625 aa  75.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  27.31 
 
 		 612 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  27.24 
 
 		 616 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.13 
 
 		 704 aa  72  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.77 
 
 		 932 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1421 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  25.51 
 
 		 1032 aa  71.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 766 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 728 aa  70.5  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 726 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  28.57 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.62 
 
 		 833 aa  69.3  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0754  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.92 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.643559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  24.15 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.65 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  28.39 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  29.58 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.63 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.79 
 
 		 732 aa  67.8  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.04 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.62 
 
 		 837 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  25.97 
 
 		 712 aa  66.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4751  UvrD/REP helicase family protein  27.47 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.4 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  23.37 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  27.18 
 
 		 1047 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00006002  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  20.45 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 593 aa  65.1  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  30.57 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  24.75 
 
 		 771 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.55 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 708 aa  64.3  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 689 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>