More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04540 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 320 aa  659    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.19 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.88 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3443  transcriptional regulator, LuxR family  21.76 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00126305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  44.29 
 
 		 878 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 160 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  45.76 
 
 		 213 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.76 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.89 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 523 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 498 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  54.17 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 454 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  48.08 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 508 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  50 
 
 		 471 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  50 
 
 		 917 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3965  LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 368 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 954 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 975 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 230 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 216 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  30.66 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 907 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 907 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0316  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.155222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.79 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6781  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  26 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 907 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1961  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 535 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.08 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 224 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  43.4 
 
 		 937 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 100 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  46.43 
 
 		 919 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 506 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>