More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4768 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  68.84 
 
 
412 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  71.13 
 
 
408 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  58.96 
 
 
414 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  57.98 
 
 
407 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  57.98 
 
 
407 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  57.71 
 
 
411 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  57.98 
 
 
411 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  55.75 
 
 
405 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  56.03 
 
 
403 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  55.76 
 
 
403 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  52.77 
 
 
414 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  59.62 
 
 
382 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  51.78 
 
 
411 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  53.1 
 
 
409 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  59.29 
 
 
425 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  52.21 
 
 
403 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  57.59 
 
 
416 aa  359  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 
408 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
405 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  53.35 
 
 
399 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  57.39 
 
 
407 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  56.65 
 
 
419 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  51.97 
 
 
407 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  49.75 
 
 
394 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  49.75 
 
 
394 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  51.06 
 
 
394 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  55.08 
 
 
403 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  56.78 
 
 
411 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 
411 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  51.32 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  53.58 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  50 
 
 
360 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  48.35 
 
 
367 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  47.38 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  50.13 
 
 
411 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 
420 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
409 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  48.94 
 
 
405 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
399 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  39.29 
 
 
401 aa  285  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  39.54 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  50.42 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  47.49 
 
 
423 aa  275  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  45.55 
 
 
422 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  48.99 
 
 
405 aa  266  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  40.47 
 
 
392 aa  256  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  42.54 
 
 
392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  43.73 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 
409 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.31 
 
 
430 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  42.98 
 
 
390 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
388 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  42.98 
 
 
390 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  40 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  42.98 
 
 
390 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  42.98 
 
 
390 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  42.98 
 
 
390 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  42.98 
 
 
390 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  42.69 
 
 
390 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  40.21 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.13 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  42.69 
 
 
390 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  40.46 
 
 
388 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  39.42 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  45.99 
 
 
440 aa  236  8e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  39.74 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  42.74 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  40 
 
 
406 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 
391 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  40.8 
 
 
400 aa  233  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
391 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  38.89 
 
 
416 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  38.89 
 
 
391 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  39.48 
 
 
407 aa  231  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
406 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
388 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 
386 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  41.88 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
388 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  40.89 
 
 
390 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  38.17 
 
 
412 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  38.4 
 
 
389 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  37.34 
 
 
408 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  38.4 
 
 
389 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.47 
 
 
388 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  38.4 
 
 
389 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  41.48 
 
 
395 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
391 aa  226  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  40.83 
 
 
392 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  38.97 
 
 
389 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  41.76 
 
 
393 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
386 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  38.62 
 
 
389 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>