257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2913 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
325 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  54.97 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  53.38 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  50.65 
 
 
331 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  49.22 
 
 
329 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  50.97 
 
 
331 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  52.58 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  43.56 
 
 
447 aa  232  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  46.36 
 
 
332 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  44.52 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  40.85 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  38.66 
 
 
319 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  38.8 
 
 
475 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  38.27 
 
 
323 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  38.31 
 
 
443 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  33.52 
 
 
350 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  31.91 
 
 
376 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  32.77 
 
 
340 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  32.6 
 
 
358 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  32.6 
 
 
358 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  34.67 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 
353 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  31.62 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  31.15 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
348 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  29.66 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  31.65 
 
 
346 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  31.22 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  31.05 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  30.79 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  28.83 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
344 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00272  Phosphotransferase enzyme family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02880)  27.6 
 
 
364 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0403488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  33.04 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  30.51 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  29.86 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  29.49 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  29.28 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  27.61 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4318  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1901  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.05669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1947  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1881  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  26.91 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03575  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000000417881  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.34 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  30.88 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.71 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  31.62 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  32.42 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.48 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02490  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 
428 aa  77  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  27.41 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1706  aminoglycoside phosphotransferase  28.18 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.9599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  27.25 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  28.9 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0370  aminoglycoside phosphotransferase  27.78 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.380981  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  29.6 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  29.57 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  30.87 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  29.41 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  32.51 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  26.23 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  26.35 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25.78 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  31.16 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  29.23 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  28.51 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  26.82 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>