More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1650 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1650  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
460 aa  897    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 
988 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.93 
 
 
818 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.94 
 
 
1022 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.88 
 
 
1056 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.88 
 
 
784 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 
1056 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.57 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  47.14 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.28 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.03 
 
 
553 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  44.3 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.95 
 
 
504 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.29 
 
 
528 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.95 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.43 
 
 
541 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
649 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.82 
 
 
706 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
605 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
1421 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 
392 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.67 
 
 
706 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.54 
 
 
471 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.56 
 
 
778 aa  94  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 
373 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
617 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.73 
 
 
582 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
450 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
428 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.2 
 
 
1676 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
361 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.93 
 
 
738 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
878 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.04 
 
 
542 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 
810 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.3 
 
 
632 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.73 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.82 
 
 
1694 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  30.52 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
1094 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
4079 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 
839 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
3035 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 
458 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  28.39 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 
689 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 
1276 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.02 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.56 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
3560 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.19 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.12 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
4489 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.36 
 
 
837 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.32 
 
 
746 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
662 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.75 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 
927 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  23.95 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 
1056 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.64 
 
 
820 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
301 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
739 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
683 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
750 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
740 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.18 
 
 
725 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 
314 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
711 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.52 
 
 
936 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
404 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
391 aa  63.2  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.71 
 
 
622 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
280 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
1827 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
3172 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
804 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
1737 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
833 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.69 
 
 
707 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 
548 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.45 
 
 
832 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
318 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>