More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1343 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  50.94 
 
 
701 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  53.2 
 
 
702 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  53.67 
 
 
714 aa  734    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  49.78 
 
 
702 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  53.25 
 
 
695 aa  751    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  100 
 
 
701 aa  1436    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  52.37 
 
 
698 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  54.44 
 
 
708 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  52.4 
 
 
717 aa  720    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  53.2 
 
 
702 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  53.19 
 
 
713 aa  729    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  53.68 
 
 
715 aa  734    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  52.88 
 
 
697 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  59.97 
 
 
696 aa  837    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  54.03 
 
 
699 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  50.22 
 
 
702 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  52.18 
 
 
700 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  59.97 
 
 
695 aa  839    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  52.23 
 
 
703 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  52.17 
 
 
756 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  52.34 
 
 
714 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  52.71 
 
 
713 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  49.21 
 
 
710 aa  667    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  52.85 
 
 
711 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  53.1 
 
 
715 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  52.8 
 
 
701 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  50.58 
 
 
696 aa  705    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  52.77 
 
 
705 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  54.23 
 
 
702 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  50.22 
 
 
709 aa  697    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  45.74 
 
 
696 aa  630  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  44.17 
 
 
721 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  45.32 
 
 
710 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  42.84 
 
 
686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.74 
 
 
671 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  43.2 
 
 
705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  43.11 
 
 
688 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.38 
 
 
682 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.91 
 
 
711 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  42.48 
 
 
686 aa  555  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  42.94 
 
 
685 aa  555  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  44.67 
 
 
686 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  43.21 
 
 
697 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  42.26 
 
 
691 aa  526  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  42.62 
 
 
710 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  43.79 
 
 
688 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  43.3 
 
 
678 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.75 
 
 
697 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  42.7 
 
 
698 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  42.58 
 
 
698 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.82 
 
 
715 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  38.67 
 
 
719 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  41.63 
 
 
706 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  41.63 
 
 
706 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  41.63 
 
 
706 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  40.14 
 
 
739 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  40.79 
 
 
709 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.31 
 
 
696 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  40.28 
 
 
717 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  41.61 
 
 
719 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  37.95 
 
 
725 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  38.12 
 
 
696 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  40.56 
 
 
726 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.61 
 
 
690 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  41.5 
 
 
696 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  41.15 
 
 
695 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  38.93 
 
 
683 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  38.93 
 
 
683 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  38.93 
 
 
683 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.35 
 
 
678 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  41.55 
 
 
680 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.93 
 
 
680 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  38.63 
 
 
677 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.78 
 
 
680 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  41.69 
 
 
680 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  40.31 
 
 
712 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  40.53 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  40.58 
 
 
682 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.83 
 
 
685 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.24 
 
 
686 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  39.22 
 
 
685 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  37.3 
 
 
683 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  37.09 
 
 
704 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  37.74 
 
 
711 aa  465  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  38.82 
 
 
711 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  38.82 
 
 
711 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  38.41 
 
 
683 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  38.82 
 
 
711 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  38.91 
 
 
678 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  38.96 
 
 
711 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  37.1 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  38.87 
 
 
711 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  39.82 
 
 
703 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  38.1 
 
 
700 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  38.37 
 
 
683 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  38.53 
 
 
711 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  38.67 
 
 
711 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  38.59 
 
 
683 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  36.35 
 
 
697 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  39.17 
 
 
706 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>