More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1200 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  47.92 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.87 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  48.28 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  47.2 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  47.52 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.48 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.48 
 
 		 283 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.16 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  46.69 
 
 		 289 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.18 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  46.13 
 
 		 308 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 287 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  43.62 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.11 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.9 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.86 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  42.25 
 
 		 289 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.2 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.66 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.55 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  41.55 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.72 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  45.86 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  41.55 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.24 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.1 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  39.26 
 
 		 317 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39.6 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  34.74 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  36.84 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.46 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  34.59 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  31.62 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  34.98 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.92 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.15 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.33 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  35.74 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.64 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  30.39 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  32.25 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.58 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.42 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  35.35 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  34.68 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.35 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  33.78 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  34.34 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.78 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.9 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  31.77 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  29.84 
 
 		 361 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1216  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.83 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2307  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.83 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.979357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>