More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1010 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1099    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  44.34 
 
 
461 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.52 
 
 
513 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.13 
 
 
501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  30.24 
 
 
598 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  50.36 
 
 
661 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.05 
 
 
584 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3682  flagellar basal body FlaE domain protein  27.67 
 
 
562 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  27.35 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  33.66 
 
 
434 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3477  flagellar basal body rod protein:protein of unknown function DUF1078:flagellar basal body FlaE  27.67 
 
 
582 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  38.99 
 
 
474 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  37.08 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.86 
 
 
488 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  35 
 
 
433 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
845 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  42.86 
 
 
419 aa  117  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.45 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  28.12 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  38.81 
 
 
465 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  38.81 
 
 
465 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  33.58 
 
 
838 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  42.24 
 
 
613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  31.5 
 
 
421 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  32.41 
 
 
819 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  29.7 
 
 
463 aa  113  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.26 
 
 
508 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  42.45 
 
 
452 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  42.75 
 
 
475 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  46.43 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
875 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  27.75 
 
 
705 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  39.35 
 
 
440 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.03 
 
 
428 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  33.6 
 
 
851 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.27 
 
 
636 aa  111  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  35.57 
 
 
422 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  37.66 
 
 
398 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  32.02 
 
 
814 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.73 
 
 
415 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  40.29 
 
 
623 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  40.37 
 
 
419 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  31.54 
 
 
412 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  35.91 
 
 
430 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  40.29 
 
 
750 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.16 
 
 
394 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.25 
 
 
428 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  32.8 
 
 
425 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  38.13 
 
 
441 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 
426 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  40.58 
 
 
417 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  33.59 
 
 
519 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  27.38 
 
 
565 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  30.8 
 
 
421 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  36.4 
 
 
396 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  34.72 
 
 
418 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.67 
 
 
426 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.27 
 
 
390 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  35.45 
 
 
430 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.97 
 
 
525 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 
407 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.85 
 
 
397 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  32.42 
 
 
911 aa  103  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  34.63 
 
 
402 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  43.07 
 
 
413 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  33.46 
 
 
814 aa  102  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  42.28 
 
 
479 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  32.3 
 
 
702 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 
414 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 
414 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  34.53 
 
 
415 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 
414 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  31.94 
 
 
414 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.57 
 
 
395 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  34.72 
 
 
442 aa  100  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.44 
 
 
428 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  29.3 
 
 
770 aa  100  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  29.64 
 
 
425 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  32.84 
 
 
409 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  37.5 
 
 
501 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0751  hypothetical protein  43.1 
 
 
282 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  37.89 
 
 
454 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.68 
 
 
276 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  32.16 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  42 
 
 
599 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  39.16 
 
 
400 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  29.3 
 
 
440 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  39.15 
 
 
432 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.09 
 
 
808 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.8 
 
 
426 aa  98.2  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.16 
 
 
400 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 
398 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  32.69 
 
 
408 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.68 
 
 
408 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  30.2 
 
 
718 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  37.23 
 
 
538 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.31 
 
 
545 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.4 
 
 
399 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  29.32 
 
 
407 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>