54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3577 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1022 aa  2033    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  32.41 
 
 		 1838 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.51 
 
 		 1009 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.32 
 
 		 2807 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.24 
 
 		 1557 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.03 
 
 		 1340 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.23 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.74 
 
 		 2194 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.58 
 
 		 616 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  37.21 
 
 		 872 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.85 
 
 		 1012 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.53 
 
 		 813 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.86 
 
 		 1118 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.86 
 
 		 1225 aa  65.1  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.76 
 
 		 1113 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.72 
 
 		 1222 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.61 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.84 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.69 
 
 		 1019 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1289 aa  58.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  23.21 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  29.08 
 
 		 386 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.21 
 
 		 3197 aa  57.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.83 
 
 		 485 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.8 
 
 		 889 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.1 
 
 		 1337 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.07 
 
 		 891 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.29 
 
 		 472 aa  54.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.25 
 
 		 1490 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  23.08 
 
 		 917 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  31.16 
 
 		 379 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  30.04 
 
 		 469 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.05 
 
 		 1275 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  32.26 
 
 		 447 aa  51.6  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.22 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.75 
 
 		 3197 aa  51.6  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  29.53 
 
 		 1129 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  28.38 
 
 		 554 aa  48.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  29.13 
 
 		 524 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0330  FG-GAP repeat protein  27.86 
 
 		 732 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.87032  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  23.26 
 
 		 1282 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  26.04 
 
 		 3474 aa  47.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 829 aa  46.2  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  31.25 
 
 		 720 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 517 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.27 
 
 		 1348 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.41 
 
 		 412 aa  45.8  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  26.35 
 
 		 621 aa  45.8  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.32 
 
 		 604 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.69 
 
 		 1527 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  25.43 
 
 		 811 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  26.36 
 
 		 1976 aa  45.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  24.11 
 
 		 2064 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>