More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1558 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 294 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  52.16 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  48.94 
 
 		 282 aa  298  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  47.46 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  51.87 
 
 		 295 aa  278  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  51.24 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 		 278 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  45.26 
 
 		 278 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  47.01 
 
 		 269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  47.31 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  49.64 
 
 		 282 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  46.52 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  48.25 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  44.79 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  43.8 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  45.95 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  42.81 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  44.23 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  42.71 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  38.69 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  45.14 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  42.15 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  37.68 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  35.99 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  42.69 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  37 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  37.69 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  35.94 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  35.94 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  34.3 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  37.18 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  35.87 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 606 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  31.65 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 604 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  32.56 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  34.06 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 478 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  37.61 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  28.3 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.7 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 633 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  37.61 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.96 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  37.17 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.96 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1183  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4244  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.59 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05410  ABC transporter  27.74 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3932  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0190  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0325  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.606531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  26.24 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.27 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1732  hypothetical protein  25.1 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0602  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.428265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  26.46 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  26.48 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3884  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  26.78 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2422  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0816937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  27.91 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5199  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>