More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7001 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1658 aa  3254    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
2551 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 
1874 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 
1656 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.86 
 
 
1354 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  40.88 
 
 
3130 aa  772    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.43 
 
 
1559 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.18 
 
 
1559 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  37.67 
 
 
1087 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.25 
 
 
1349 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
2762 aa  632  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.04 
 
 
1349 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.69 
 
 
1587 aa  618  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
3693 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
3693 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  42.74 
 
 
3158 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 
3702 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  38.68 
 
 
1795 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.36 
 
 
3176 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  42.6 
 
 
3463 aa  606  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.03 
 
 
3676 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.47 
 
 
3679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.64 
 
 
1101 aa  598  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.82 
 
 
3696 aa  600  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.21 
 
 
4478 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.98 
 
 
1337 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 
1653 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  40.11 
 
 
2477 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.67 
 
 
1372 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  40.75 
 
 
7210 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
3711 aa  582  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  28.3 
 
 
1612 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  41.82 
 
 
4080 aa  580  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  28.36 
 
 
1612 aa  579  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  39.94 
 
 
2880 aa  575  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  38.81 
 
 
3493 aa  576  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
3092 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 
5154 aa  573  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  42.04 
 
 
3494 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.77 
 
 
1144 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  40.46 
 
 
1548 aa  569  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.67 
 
 
950 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
7110 aa  566  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 
3033 aa  566  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  42.38 
 
 
7279 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 
1582 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.61 
 
 
5400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 
3254 aa  561  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  41.05 
 
 
2113 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  39.53 
 
 
1602 aa  558  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.75 
 
 
2230 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.38 
 
 
1939 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  39.69 
 
 
4151 aa  559  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 
2367 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  40.18 
 
 
1789 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  39.02 
 
 
2066 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  39.19 
 
 
3337 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  37.87 
 
 
1955 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
1816 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  41.13 
 
 
2374 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.88 
 
 
6889 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.94 
 
 
2462 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  35.47 
 
 
3252 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  40.81 
 
 
2376 aa  546  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  42.98 
 
 
3148 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  39.04 
 
 
3645 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  40.49 
 
 
2890 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  42.03 
 
 
3670 aa  546  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.86 
 
 
1831 aa  543  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.48 
 
 
2719 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  38.07 
 
 
1402 aa  543  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  41.61 
 
 
5255 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.94 
 
 
2333 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.04 
 
 
2551 aa  540  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
1837 aa  539  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.09 
 
 
4840 aa  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  39.05 
 
 
3449 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
1424 aa  536  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  37.33 
 
 
1114 aa  536  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  40.9 
 
 
1071 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.47 
 
 
1126 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.92 
 
 
3427 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  38.29 
 
 
2108 aa  535  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.77 
 
 
2136 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 
1577 aa  536  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  39.52 
 
 
3408 aa  533  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.71 
 
 
1305 aa  533  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  35.52 
 
 
4647 aa  527  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.02 
 
 
2078 aa  529  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  35.59 
 
 
3093 aa  527  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  31.88 
 
 
1574 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  33.97 
 
 
3718 aa  529  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.58 
 
 
1804 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.99 
 
 
1867 aa  529  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  38.75 
 
 
4882 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.83 
 
 
3424 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  35.98 
 
 
1535 aa  528  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  29.86 
 
 
1833 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  38.48 
 
 
2047 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  36.86 
 
 
2081 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>