More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6929 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6929  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00438766  hitchhiker  0.00101304 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5158  AAA ATPase, central region  50 
 
 		 311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0242102  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1826  ATPase central domain-containing protein  48.36 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1267  ATPase central domain-containing protein  45.7 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2342  AAA ATPase, central region  45.7 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434105  unclonable  0.000000175529 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00690  regulation of meiosis-related protein, putative  33.82 
 
 		 578 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_3211  predicted protein  35.63 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.713787  normal  0.107515 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13779  predicted protein  34.32 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  30.84 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.77 
 
 		 754 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.62 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  29.22 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  24.45 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.07 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33 
 
 		 754 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  31.87 
 
 		 585 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.44 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  29.65 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  29.26 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  27.04 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.15 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  30.54 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.58 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  26.96 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  29.31 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  27.91 
 
 		 718 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  27.62 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  27.23 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.65 
 
 		 754 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  28.88 
 
 		 493 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  30.88 
 
 		 754 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  31.8 
 
 		 613 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.54 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  31.91 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.61 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.94 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.03 
 
 		 718 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.27 
 
 		 736 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.78 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.17 
 
 		 742 aa  69.7  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.82 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.5 
 
 		 759 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.16 
 
 		 756 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  29.02 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  25.45 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.69 
 
 		 768 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  30.57 
 
 		 746 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.35 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  26.24 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.9 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.05 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.26 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  31.87 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_002978  WD0472  AAA family ATPase  27.68 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0845041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  26.02 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.94 
 
 		 739 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  27.85 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  30.26 
 
 		 739 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  28.76 
 
 		 446 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.82 
 
 		 753 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  27.11 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10191  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04270)  30 
 
 		 1631 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  28.12 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  28.22 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  29.06 
 
 		 1193 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 		 742 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  26.02 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  26.52 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  28.88 
 
 		 635 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 		 743 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.27 
 
 		 852 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  27.43 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.95 
 
 		 721 aa  65.9  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.65 
 
 		 713 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  28.75 
 
 		 703 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 826 aa  65.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.75 
 
 		 723 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.49 
 
 		 801 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.56 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  27.92 
 
 		 601 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  28.93 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.56 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.32 
 
 		 808 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  30.21 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  32.32 
 
 		 832 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  30.47 
 
 		 513 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  27.65 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.39 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.24 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  29.76 
 
 		 829 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  27.45 
 
 		 866 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  28.89 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  27.98 
 
 		 930 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.65 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  23.58 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  26.4 
 
 		 804 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.35 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>