More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5200 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.27 
 
 
223 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.59 
 
 
365 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
383 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
248 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.71 
 
 
234 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0965608  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 
239 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
235 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
253 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
243 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0980  putative exported oxidoreductase  30.84 
 
 
239 aa  95.5  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 
230 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
264 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  31.75 
 
 
253 aa  94  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  34.55 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.691642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
251 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
242 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  36.17 
 
 
245 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
277 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.77 
 
 
250 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  36.41 
 
 
247 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  28.33 
 
 
254 aa  89  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  38.3 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2473  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.733857  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  38.14 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2119  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.860412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.87 
 
 
256 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
291 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
245 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.18 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0535  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2660  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
276 aa  85.5  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219801  unclonable  0.0000000271181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  32 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.82 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  28.38 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0807012  hitchhiker  0.000000111749 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1632  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2728  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.03 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.16 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
338 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0132  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  36.87 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3108  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.61 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000459649  unclonable  0.0000000000323747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.43 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07831  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.956383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>