More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0060 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
365 aa  724    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.97 
 
 
383 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.12 
 
 
223 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.59 
 
 
259 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.44 
 
 
234 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0965608  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
235 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
239 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8805  hypothetical protein  48.78 
 
 
133 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
260 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
247 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
284 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
260 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
247 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
261 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
284 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
253 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
247 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.47 
 
 
269 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.39 
 
 
251 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  35.75 
 
 
258 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
252 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2332  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.24 
 
 
149 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000837471  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
241 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
254 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1497  NAD/NADP dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
246 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 
258 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.83 
 
 
249 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
241 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
250 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
245 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  34.62 
 
 
247 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  38.34 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
239 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2152  ATPase FliI/YscN  32.76 
 
 
254 aa  97.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0980  putative exported oxidoreductase  32.1 
 
 
239 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
249 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 
246 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05991  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 
254 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 
247 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
260 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
277 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
262 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
257 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.86 
 
 
250 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
261 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05611  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 
244 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.713488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
246 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0485  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.1 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.334807  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.92 
 
 
236 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
251 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1160  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 
246 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0211991  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000874  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  33.49 
 
 
243 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
295 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
250 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
256 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
340 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
295 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
255 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
338 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
256 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  34.65 
 
 
243 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
245 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0646  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
241 aa  93.6  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
246 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
253 aa  93.2  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
293 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  33.93 
 
 
247 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26420  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  32.55 
 
 
235 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  34.54 
 
 
247 aa  92.8  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
250 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
247 aa  92.8  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
244 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
257 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
217 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
300 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
258 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05911  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
244 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.45 
 
 
257 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
261 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
256 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>