More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2287 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  38.78 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  37.62 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  38.31 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  38.51 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  37.76 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  37.46 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  37.29 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  36.95 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  36.61 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  37.84 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  38.41 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  38.61 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  38.44 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  37.33 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  37.84 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  37.84 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  35.47 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  36.18 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  34.53 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  35.92 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  34.21 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 289 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1641  putative NAD(P)-dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  33.8 
 
 		 269 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.44 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  36.16 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  36.41 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.41 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  32.83 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 595 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 		 596 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 590 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 596 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 		 595 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>