197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3514 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  100 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  58.21 
 
 		 293 aa  333  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  55.28 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  53.85 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.5 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  53.5 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  53.5 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  53.17 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  57.25 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  49.66 
 
 		 290 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  54.07 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  52.98 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  52.86 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  53.68 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  53.33 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  53.33 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  50 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  35.62 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  56.62 
 
 		 145 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  32.61 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.9 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  28.17 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.06 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.36 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.24 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  29.82 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  27.44 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  24.82 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  30.74 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  27.8 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.51 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  29.35 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  28.95 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.91 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  24.57 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.24 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.62 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.54 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.03 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.86 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.95 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.95 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.63 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.48 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.18 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.18 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.55 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  23.43 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.66 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  23.21 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  22.71 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  23.66 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.66 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  23.66 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.3 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.66 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  23.6 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  22.58 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.3 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.27 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.3 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.24 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  24.41 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  22.58 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  30.23 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.24 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  21.29 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25.13 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  23.4 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.81 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.88 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  23.77 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.28 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  24.9 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  23.42 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.29 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.4 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>