184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03320 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03320  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  100 
 
 		 511 aa  1044    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.393554  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41524  predicted protein  26.1 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.152567  normal  0.428654 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04771  ribosomal assembly complex component Ipi3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06580)  26.86 
 
 		 573 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855526  normal  0.61445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.62 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.71 
 
 		 1523 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.1 
 
 		 1454 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.93 
 
 		 1188 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1214 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.26 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.18 
 
 		 1652 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  30.77 
 
 		 884 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  29.37 
 
 		 826 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.74 
 
 		 1242 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 		 1236 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  21.95 
 
 		 1484 aa  60.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.58 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  30.57 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.43 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_8186  predicted protein  30.33 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0130638  hitchhiker  0.000127213 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  23.72 
 
 		 851 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.73 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.77 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.14 
 
 		 1004 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 1711 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.33 
 
 		 1363 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 		 954 aa  57  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.34 
 
 		 1161 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.21 
 
 		 1364 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.34 
 
 		 1161 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.08 
 
 		 1163 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 		 1164 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 1190 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.96 
 
 		 1901 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.35 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 687 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  21.68 
 
 		 657 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.85 
 
 		 774 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  23.34 
 
 		 1416 aa  54.3  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.17 
 
 		 947 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1686 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.27 
 
 		 1213 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.85 
 
 		 1760 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1643  WD-40 repeat protein  23.88 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.21 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  30.08 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.53 
 
 		 1188 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1670  WD-40 repeat protein  23.88 
 
 		 520 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 1334 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  34.23 
 
 		 1878 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  23.75 
 
 		 816 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.81 
 
 		 742 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1661 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.83 
 
 		 930 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  35.82 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1858 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.6 
 
 		 1823 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.06 
 
 		 1280 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 		 778 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.55 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.8 
 
 		 363 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20 
 
 		 698 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 		 1373 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 		 1193 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1552 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.8 
 
 		 1256 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.79 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.43 
 
 		 740 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.37 
 
 		 675 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  26.8 
 
 		 363 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 		 1183 aa  51.6  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.38 
 
 		 574 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.63 
 
 		 1190 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.04 
 
 		 1262 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1176 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.54 
 
 		 1868 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 		 1208 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 		 317 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 		 576 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  30 
 
 		 248 aa  50.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03240  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24 
 
 		 316 aa  50.1  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.47 
 
 		 630 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1427 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.12 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.87 
 
 		 1209 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.79 
 
 		 898 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.26 
 
 		 728 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  26.72 
 
 		 914 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.29 
 
 		 1607 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1477 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  27.38 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 		 1411 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  22.27 
 
 		 1330 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.09 
 
 		 1039 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>