More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02500 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC02500  ATPase, putative  100 
 
 		 939 aa  1932    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.791376  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_432  predicted protein  42.38 
 
 		 829 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0880854  normal  0.487842 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06316  ATP-binding protein (Eurofung)  43.33 
 
 		 1228 aa  277  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58454  predicted protein  33.7 
 
 		 809 aa  230  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0929212 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14607  predicted protein  32.18 
 
 		 337 aa  163  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.501177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  31.59 
 
 		 566 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 586 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  31.11 
 
 		 566 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  28.95 
 
 		 736 aa  145  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  30.85 
 
 		 566 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  30.11 
 
 		 695 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  30.25 
 
 		 765 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 		 767 aa  140  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 		 557 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  29.89 
 
 		 603 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  28.3 
 
 		 744 aa  139  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.56 
 
 		 639 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  29.83 
 
 		 584 aa  139  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.51 
 
 		 641 aa  137  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  29.86 
 
 		 709 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04630  DNA binding protein, putative  26.68 
 
 		 765 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.28 
 
 		 640 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.92 
 
 		 633 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  28.69 
 
 		 589 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  30.94 
 
 		 738 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 633 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  28.87 
 
 		 628 aa  134  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  30.2 
 
 		 645 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  31.37 
 
 		 711 aa  132  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  28.21 
 
 		 559 aa  132  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  30.6 
 
 		 648 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  30.56 
 
 		 652 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  29.89 
 
 		 636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  29.64 
 
 		 730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.13 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 		 623 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  30.26 
 
 		 614 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  30.55 
 
 		 647 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 		 681 aa  129  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 		 610 aa  129  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 633 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.29 
 
 		 582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 		 605 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  28.17 
 
 		 647 aa  128  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51248  predicted protein  27.76 
 
 		 722 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0753689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  31.75 
 
 		 670 aa  128  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 632 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  30.55 
 
 		 635 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  30.45 
 
 		 625 aa  127  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  26.93 
 
 		 611 aa  127  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  29.17 
 
 		 668 aa  127  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  28.53 
 
 		 615 aa  127  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  29.63 
 
 		 709 aa  126  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  29.44 
 
 		 608 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 		 629 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  27.61 
 
 		 624 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  30.83 
 
 		 595 aa  125  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 633 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  29.29 
 
 		 631 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  30.83 
 
 		 595 aa  125  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 605 aa  125  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  29.64 
 
 		 635 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  29.8 
 
 		 755 aa  125  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  29.87 
 
 		 611 aa  124  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  29.43 
 
 		 692 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  30.55 
 
 		 695 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  29.25 
 
 		 656 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 		 648 aa  124  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  31.58 
 
 		 617 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  28.06 
 
 		 645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  30.43 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.23 
 
 		 652 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  28.83 
 
 		 608 aa  123  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  29.41 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.29 
 
 		 630 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  27.39 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 611 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 		 630 aa  123  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  29.91 
 
 		 620 aa  122  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 621 aa  122  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  29.69 
 
 		 763 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  27.88 
 
 		 644 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  28.65 
 
 		 665 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  29.95 
 
 		 582 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 608 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.65 
 
 		 655 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.42 
 
 		 641 aa  122  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  29.1 
 
 		 632 aa  121  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  28.37 
 
 		 635 aa  121  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  29.16 
 
 		 631 aa  121  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  28.37 
 
 		 635 aa  121  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  30.41 
 
 		 603 aa  121  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  28.37 
 
 		 635 aa  121  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 618 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 618 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  27.88 
 
 		 648 aa  121  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 		 598 aa  120  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  28.35 
 
 		 601 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 618 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 618 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>