More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04630 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04630  DNA binding protein, putative  100 
 
 		 765 aa  1586    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  42.19 
 
 		 744 aa  594  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  37.76 
 
 		 736 aa  477  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51248  predicted protein  35.29 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0753689 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  31.61 
 
 		 695 aa  306  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 626 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  35.96 
 
 		 692 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 644 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.91 
 
 		 639 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 644 aa  219  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.1 
 
 		 626 aa  217  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  38.05 
 
 		 630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 		 656 aa  214  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.44 
 
 		 622 aa  213  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  34.33 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.73 
 
 		 626 aa  213  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  35.69 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  35.28 
 
 		 695 aa  213  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  34.93 
 
 		 665 aa  212  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.63 
 
 		 615 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 		 628 aa  210  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  34.07 
 
 		 755 aa  210  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  32.85 
 
 		 608 aa  210  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  36.34 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 610 aa  210  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 647 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  35.53 
 
 		 576 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 		 622 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  31.87 
 
 		 617 aa  208  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 669 aa  208  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.61 
 
 		 619 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  35.17 
 
 		 623 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  35.78 
 
 		 623 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.31 
 
 		 628 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.85 
 
 		 624 aa  207  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2625  DNA mismatch repair protein MutL  35.24 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.68 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 574 aa  206  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  34.62 
 
 		 559 aa  206  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.51 
 
 		 630 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.17 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  35.24 
 
 		 652 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.33 
 
 		 620 aa  205  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  38.02 
 
 		 621 aa  205  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.17 
 
 		 633 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  33.62 
 
 		 709 aa  205  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 		 607 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  33.63 
 
 		 618 aa  204  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  33.05 
 
 		 628 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 633 aa  204  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.27 
 
 		 647 aa  203  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.08 
 
 		 631 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  35.47 
 
 		 612 aa  203  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  33.52 
 
 		 607 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 630 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  35.99 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  33.52 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  34.82 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 628 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.89 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.56 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.88 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 634 aa  201  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.81 
 
 		 648 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 645 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.4 
 
 		 649 aa  201  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 622 aa  201  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.63 
 
 		 647 aa  200  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  33.51 
 
 		 647 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.03 
 
 		 585 aa  200  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  35.63 
 
 		 659 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.13 
 
 		 611 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.49 
 
 		 629 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.11 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 650 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 		 603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  33.14 
 
 		 606 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 611 aa  198  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 647 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.98 
 
 		 626 aa  198  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 		 633 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 		 668 aa  198  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 		 605 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 		 632 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 629 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 626 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.25 
 
 		 647 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 626 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.25 
 
 		 647 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.25 
 
 		 647 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>