More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89086 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_89086  predicted protein  100 
 
 		 736 aa  1511    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00126  DNA mismatch repair protein Mlh1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11700)  40.58 
 
 		 744 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04630  DNA binding protein, putative  37.53 
 
 		 765 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51248  predicted protein  34.69 
 
 		 722 aa  431  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0753689 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  28.37 
 
 		 695 aa  260  8e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.57 
 
 		 644 aa  233  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 632 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  33.1 
 
 		 608 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  35.32 
 
 		 626 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 		 630 aa  217  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 633 aa  217  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 		 633 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  37.64 
 
 		 652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 602 aa  215  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 		 633 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.82 
 
 		 626 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 		 623 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  35.47 
 
 		 623 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 		 669 aa  211  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 		 639 aa  211  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 		 641 aa  210  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  37.15 
 
 		 650 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 649 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 		 738 aa  207  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 652 aa  207  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 661 aa  207  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 		 645 aa  207  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 661 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 669 aa  207  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 635 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  34.86 
 
 		 618 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 635 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 		 629 aa  206  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.13 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 		 617 aa  206  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 		 661 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 		 624 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  38.08 
 
 		 618 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 628 aa  204  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 645 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 		 626 aa  204  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 667 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 667 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 624 aa  203  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 667 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 631 aa  203  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  33.52 
 
 		 628 aa  203  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 		 661 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 		 644 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.59 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 		 648 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 618 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  34.51 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  34.12 
 
 		 670 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  36.55 
 
 		 631 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 656 aa  201  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 665 aa  200  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.62 
 
 		 566 aa  201  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  35.07 
 
 		 616 aa  200  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 662 aa  200  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 		 648 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  34.26 
 
 		 695 aa  200  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  34.14 
 
 		 628 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.81 
 
 		 644 aa  200  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  36.66 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.71 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.6 
 
 		 603 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 644 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 615 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  31.41 
 
 		 681 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.24 
 
 		 629 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  35.21 
 
 		 516 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.18 
 
 		 615 aa  198  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0226  DNA mismatch repair protein MutL  36.39 
 
 		 608 aa  198  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.34 
 
 		 643 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  35.8 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.88 
 
 		 680 aa  198  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 615 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 		 603 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 629 aa  197  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  36.36 
 
 		 615 aa  197  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 		 644 aa  197  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 653 aa  197  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 		 611 aa  197  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  36.47 
 
 		 619 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>