57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1500 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  31.83 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  28.27 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  23.47 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  23.2 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0455  polysaccharide deacetylase  23.19 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0133488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  22.13 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  20.97 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  19.01 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  23.3 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  23.3 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  18.81 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  21.07 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  20.36 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  20.69 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  22.93 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  22.98 
 
 		 386 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14351  hypothetical protein  24.32 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.188906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  20.85 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  21.36 
 
 		 672 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  22.56 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  23.5 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  22.28 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0501  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.885129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  30.12 
 
 		 590 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  20.81 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  36.56 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 510 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  21.34 
 
 		 353 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  22.53 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 270 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 347 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  18.88 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  38.1 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  32.81 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1903  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  36.67 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  26.67 
 
 		 373 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>