More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1473 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  52.78 
 
 		 375 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 		 382 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 381 aa  153  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  49.66 
 
 		 381 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  49.31 
 
 		 374 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  45.07 
 
 		 371 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  43.26 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  41.13 
 
 		 404 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 408 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  42.36 
 
 		 384 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  40.71 
 
 		 372 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 373 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 373 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  43.17 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  38.97 
 
 		 377 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.97 
 
 		 380 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 383 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 376 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.76 
 
 		 377 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 387 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 381 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 339 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 382 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  41.98 
 
 		 390 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.97 
 
 		 377 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 388 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  43.24 
 
 		 371 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 		 379 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 		 379 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 385 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 394 aa  90.9  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 		 375 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 382 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.27 
 
 		 341 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 382 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 378 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 378 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  33.33 
 
 		 370 aa  87  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  30.99 
 
 		 371 aa  86.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 390 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 		 378 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  36.43 
 
 		 382 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 378 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 		 374 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 378 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1182  putative glycosyl transferase  46.58 
 
 		 79 aa  84.3  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.202119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.13 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  33.82 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 		 377 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 387 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  31.88 
 
 		 377 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  31.88 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 409 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 379 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 385 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  33.59 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  32.81 
 
 		 376 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 398 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 362 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  33.86 
 
 		 383 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  32.56 
 
 		 376 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 371 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 387 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.67 
 
 		 364 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 369 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 		 373 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  41.86 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 426 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>