More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1134 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  634    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  48.37 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  45.15 
 
 		 314 aa  271  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.93 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  48.64 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  42.07 
 
 		 346 aa  263  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  43.79 
 
 		 362 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  48.72 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  45.48 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  43.46 
 
 		 362 aa  261  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  35.33 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  35.58 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 599 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.31 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 		 442 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  32.58 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  29.63 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  40 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 392 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.41 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  33.88 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.95 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  28.46 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  27.88 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  31.11 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  34.95 
 
 		 425 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 405 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  29.76 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 343 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  30.8 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  31.68 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.18 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  31.18 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  29.68 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  28.11 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 370 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  28.9 
 
 		 363 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 456 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 418 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 427 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 454 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  31.18 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  26.54 
 
 		 579 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.47 
 
 		 493 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 471 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  27.81 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  26.24 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  33.15 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  31.3 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  27.85 
 
 		 416 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  31.61 
 
 		 363 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  27.06 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.89 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  28.19 
 
 		 407 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  31.28 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  29.76 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 		 392 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  28.3 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 322 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  31.98 
 
 		 536 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  24.52 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  24.39 
 
 		 406 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>