200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1583 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  295  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  47.45 
 
 
139 aa  135  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  49.6 
 
 
160 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  45.32 
 
 
139 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  44.6 
 
 
139 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  44.6 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  45.26 
 
 
140 aa  114  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  48.36 
 
 
148 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  44.29 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  38.17 
 
 
162 aa  107  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  39.2 
 
 
145 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  42.34 
 
 
163 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  35.33 
 
 
184 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  39.37 
 
 
138 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  36.17 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  38.26 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  40.34 
 
 
156 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  41.18 
 
 
204 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.24 
 
 
203 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.07 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  35.83 
 
 
191 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  33.6 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  33.6 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  33.6 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.03 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  33.6 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  35.83 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  34.07 
 
 
154 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  29.01 
 
 
182 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  35 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  29.84 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  34.04 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  30.3 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  29.03 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  32.28 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32.17 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37.96 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  34.88 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  35.71 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  33.91 
 
 
175 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  35.16 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  30.65 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.82 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.26 
 
 
202 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  31.51 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  32.82 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  31.88 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  27.43 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  34.62 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.74 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  35.14 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  32.46 
 
 
328 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  34.35 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.33 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  34.96 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  36.84 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  31.58 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  29.66 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  35.96 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  31.82 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  37.17 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  34.82 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  32.79 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  39.34 
 
 
227 aa  74.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  33.63 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  32.17 
 
 
320 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  34.07 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  30.37 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  29.93 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  32.52 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  29.46 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  33.04 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.94 
 
 
302 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  29.1 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  25.58 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  30.3 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  29.84 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  32.76 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  32.74 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>