More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0663 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  84.08 
 
 
245 aa  433  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  73.14 
 
 
245 aa  371  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  73.14 
 
 
245 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 
245 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.31 
 
 
245 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  63.07 
 
 
265 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
255 aa  330  9e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  63.67 
 
 
256 aa  329  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 
255 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  60.49 
 
 
259 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5219  ABC transporter related  64.32 
 
 
257 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  60.74 
 
 
253 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3083  glutamine/glutamate ABC transporter, ATP-binding protein  60.33 
 
 
253 aa  314  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.37 
 
 
252 aa  308  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  59.18 
 
 
251 aa  297  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.3 
 
 
262 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  54.32 
 
 
259 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
242 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  55 
 
 
244 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.27 
 
 
242 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  56.54 
 
 
253 aa  284  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  52.52 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.47 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  53.33 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  54.39 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  53.59 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 
253 aa  280  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  55.7 
 
 
246 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  54.24 
 
 
263 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  53.59 
 
 
255 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  54.58 
 
 
248 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.72 
 
 
254 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  52.72 
 
 
254 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  52.72 
 
 
254 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  54.27 
 
 
247 aa  278  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  52.72 
 
 
254 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 
284 aa  278  4e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  53.56 
 
 
253 aa  278  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  57.38 
 
 
242 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  52.97 
 
 
262 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  53.81 
 
 
242 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  54.17 
 
 
251 aa  278  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54.17 
 
 
251 aa  276  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  52.5 
 
 
252 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  52.08 
 
 
254 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  53.16 
 
 
248 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  53.75 
 
 
258 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  53.75 
 
 
248 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
252 aa  275  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  54.01 
 
 
242 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
252 aa  275  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
251 aa  275  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  51.67 
 
 
250 aa  275  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  52.12 
 
 
262 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
252 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
252 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  53.39 
 
 
249 aa  275  7e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  52.12 
 
 
262 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.27 
 
 
246 aa  274  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  55.42 
 
 
249 aa  274  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  52.32 
 
 
252 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
252 aa  274  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 
252 aa  274  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  52.32 
 
 
252 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  52.32 
 
 
252 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.01 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  51.25 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  52.5 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  53.91 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  52.97 
 
 
263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  53.59 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  51.67 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  55.56 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.66 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.13 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.97 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  51.9 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  53.39 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.39 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  53.56 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  52.72 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.39 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  52.97 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  52.97 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.97 
 
 
249 aa  272  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  52.92 
 
 
261 aa  272  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  54.43 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  53.39 
 
 
242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  50.21 
 
 
265 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  52.92 
 
 
247 aa  271  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
253 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  53.97 
 
 
248 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  52.56 
 
 
273 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>