More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04755 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 875 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 876 aa  665    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 892 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 865 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 875 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 874 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 876 aa  993    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 905 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 876 aa  669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 875 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 874 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 875 aa  635    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 877 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 874 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 874 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 903 aa  661    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 882 aa  646    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 860 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 860 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 897 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 865 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 888 aa  751    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 882 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 874 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 875 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  42.63 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  68.94 
 
 		 879 aa  1253    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 876 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  42.86 
 
 		 873 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 885 aa  773    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 860 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 882 aa  677    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 897 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 887 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 886 aa  723    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 876 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 880 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 864 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 876 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 875 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 876 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 874 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 874 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 876 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 874 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 886 aa  999    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0096  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 894 aa  643    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.172086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 892 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 892 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 876 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 876 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 874 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 879 aa  903    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 874 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 874 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 874 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 876 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 905 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 890 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 884 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 874 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 874 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 886 aa  768    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 897 aa  648    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 865 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 876 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  58.68 
 
 		 877 aa  1064    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 863 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 876 aa  682    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 874 aa  642    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 874 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 869 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 888 aa  748    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 904 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 874 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 874 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3838  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 937 aa  637    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 877 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 897 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 879 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 897 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 885 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 878 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 874 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 876 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 878 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 888 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 874 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>