More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03640 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  68.75 
 
 		 307 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  64.75 
 
 		 288 aa  349  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  56.54 
 
 		 307 aa  348  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40.39 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  39.74 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  38.66 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  38.61 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  39.87 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  39.07 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  39.47 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  38.03 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  38.41 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  37.75 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  37.85 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  37.42 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.33 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  39 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  36.99 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  36.54 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 314 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  39.07 
 
 		 312 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  36.51 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.19 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  37.79 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  37.87 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  34.77 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  37.69 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  39.67 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  39.01 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  36.79 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  38.82 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  39.2 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  37.38 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1978  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000417837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  36.48 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  36.51 
 
 		 322 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  38.29 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  39.34 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  36.91 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  37.83 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  38.03 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.34 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  38.82 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  37.99 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  37.99 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  38.54 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  35.65 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>