More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0916 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0916  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 365 aa  729    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226254  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  38.06 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  38.06 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  37.78 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  37.78 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  37.78 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  38.4 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  36.34 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  36.78 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  36.78 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  37.22 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  36.78 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  36.1 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  36.78 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  36.78 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  36.78 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  36.65 
 
 		 371 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  36.6 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  36.1 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  36.1 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  36.1 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  36.1 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  36.61 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  35.92 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  35.96 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  35.79 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  36.76 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  36.49 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.38 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  34.7 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  35.6 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  36.11 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  35.8 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  33.24 
 
 		 354 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  35.41 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  35.68 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.66 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  35.41 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.41 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  33.97 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  34.39 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  33.7 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  34.05 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  34.99 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.65 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  33.69 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  33.69 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  33.51 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  33.78 
 
 		 368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  35.22 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.82 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  33.69 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  32.08 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  33.84 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.42 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  32.75 
 
 		 384 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  34.66 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  33.16 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  33.96 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  34.58 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.99 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  33.96 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  33.76 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  33.33 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.91 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.91 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  34.42 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  36.44 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  33.16 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  31.66 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  34.53 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  32.83 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  34.53 
 
 		 380 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  33.42 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  31.7 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  34.31 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.66 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  33.68 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  32.91 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  32.91 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  32.91 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  32.91 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  32.91 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  33.42 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  32.9 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  33.07 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  32.08 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  32.66 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.08 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.83 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.56 
 
 		 381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  32.09 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  31.77 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.83 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>