More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4304 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  66.55 
 
 		 298 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  62.28 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  61.59 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  62.5 
 
 		 293 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  63.73 
 
 		 298 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  63.39 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  63.73 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  63.73 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  63.39 
 
 		 298 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  65.53 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  63.05 
 
 		 298 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  64.85 
 
 		 298 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  57.49 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  54.42 
 
 		 295 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  57.73 
 
 		 294 aa  331  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  54.42 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  55.56 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  57.44 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  56.23 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  36.55 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  34.36 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  32.29 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  32.29 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  33.94 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.66 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.86 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  35.15 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.75 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.3 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.12 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.66 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.94 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  34.47 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 291 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>