More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2867 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  89.85 
 
 
582 aa  1041    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  77.65 
 
 
563 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 
591 aa  1170    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.31 
 
 
536 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.09 
 
 
539 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 
547 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  41.27 
 
 
1053 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
430 aa  187  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
506 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
651 aa  180  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  38.57 
 
 
537 aa  173  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
854 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
632 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  35.82 
 
 
492 aa  163  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
632 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  40.8 
 
 
632 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
510 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
656 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
510 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
479 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  35.47 
 
 
749 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
627 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
361 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
887 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
751 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
605 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  34.53 
 
 
603 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
712 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  28.04 
 
 
538 aa  150  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
604 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
458 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
1177 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
355 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  27.61 
 
 
495 aa  146  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
1267 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  32.02 
 
 
526 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
618 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
751 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
572 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
517 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
504 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  31.83 
 
 
796 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
536 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
499 aa  143  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
1166 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
798 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  35.64 
 
 
733 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
604 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
520 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
915 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1166 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
510 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
799 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
502 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
807 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
751 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
704 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
713 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
499 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
762 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
579 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
810 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
1669 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
761 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  35.4 
 
 
558 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5134  histidine kinase  35.37 
 
 
431 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
366 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
1354 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
714 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
591 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
556 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
1562 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
738 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0233222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
748 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1224 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
553 aa  137  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  35.09 
 
 
755 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
628 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  32.5 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
749 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
495 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  32.47 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  33.21 
 
 
767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
396 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
756 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  33.73 
 
 
812 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
941 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  36.88 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>