149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4783 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  60.87 
 
 		 613 aa  734    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  100 
 
 		 610 aa  1245    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  36.75 
 
 		 580 aa  360  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  38.85 
 
 		 586 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  37.06 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  38.76 
 
 		 584 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  38.66 
 
 		 576 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  37.02 
 
 		 599 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  32.11 
 
 		 684 aa  299  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  40.89 
 
 		 519 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  34.15 
 
 		 594 aa  270  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  33.94 
 
 		 628 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  32.63 
 
 		 578 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  34.9 
 
 		 555 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  29.26 
 
 		 606 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 		 601 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.94 
 
 		 645 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  29.28 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  29.76 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  27.86 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  27.95 
 
 		 609 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  31.11 
 
 		 594 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  29.14 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  30.9 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  29.67 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  27.26 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.69 
 
 		 602 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  30.43 
 
 		 596 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.14 
 
 		 602 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  26.59 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.59 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.8 
 
 		 595 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.59 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.37 
 
 		 602 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.59 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.93 
 
 		 810 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  31.26 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.63 
 
 		 1148 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  33.86 
 
 		 570 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.63 
 
 		 578 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.63 
 
 		 578 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  30.75 
 
 		 601 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  27.75 
 
 		 672 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  30.48 
 
 		 588 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.69 
 
 		 818 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  30.23 
 
 		 574 aa  140  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 		 1153 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 925 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.24 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.85 
 
 		 590 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  30.85 
 
 		 590 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  26.72 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.73 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.66 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.66 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  28.27 
 
 		 577 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28.33 
 
 		 615 aa  104  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 		 577 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22 
 
 		 653 aa  97.8  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.58 
 
 		 562 aa  97.1  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.41 
 
 		 577 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  26.26 
 
 		 619 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 		 991 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.21 
 
 		 563 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  24.92 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.92 
 
 		 614 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  30.06 
 
 		 998 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  30.51 
 
 		 998 aa  87  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  25.06 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  25.73 
 
 		 631 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.01 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.01 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  25.73 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.78 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.78 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.78 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.78 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  26.24 
 
 		 842 aa  84  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.26 
 
 		 610 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  20.87 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.11 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.76 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  26.41 
 
 		 625 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.52 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.88 
 
 		 618 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.25 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.18 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  24.65 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.86 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.22 
 
 		 582 aa  77.8  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  25.84 
 
 		 601 aa  77  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  22.88 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  25.88 
 
 		 599 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.98 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  23.98 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.46 
 
 		 612 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.43 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  23.15 
 
 		 608 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>