123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2843 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  100 
 
 
314 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  53.85 
 
 
313 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  53.85 
 
 
313 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  51.77 
 
 
322 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  51.16 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  50.83 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  50.83 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  42.03 
 
 
319 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  42.91 
 
 
319 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  40.67 
 
 
313 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  37.29 
 
 
297 aa  208  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  37.75 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  37.58 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  38.94 
 
 
299 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  35.39 
 
 
318 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  34.9 
 
 
318 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  36.21 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  36.09 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  35.76 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  35.76 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  33.78 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  31.89 
 
 
290 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  28.43 
 
 
288 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
302 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
276 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
285 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
347 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
275 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
277 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
304 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
279 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.48 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  26.53 
 
 
387 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
282 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  26.84 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
339 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.91 
 
 
277 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  29.64 
 
 
273 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  25.08 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  24.5 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1960  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184486  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4877  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.28 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5469  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5393  amidohydrolase 2  26.18 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  25.83 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6032  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0815871  normal  0.0588089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  27.24 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  29.77 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  29.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  29.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  29.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  29.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  29.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
335 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  24.67 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  26.01 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  27.6 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  28.48 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  28.01 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  21 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  23.57 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  26.17 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  24.28 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  26.69 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6104  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105705  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  25.42 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  28.99 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  27.61 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  27.67 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  23.08 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>