206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1053 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  634    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  74.31 
 
 		 313 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  72.82 
 
 		 313 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  74.14 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  71.19 
 
 		 321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  70.86 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  68.84 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  67.81 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  58.48 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  60.43 
 
 		 297 aa  348  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  59.86 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  60.84 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  38.29 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  31.76 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  28.57 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  30.66 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  30.45 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 471 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  28.62 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  27.46 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  28.08 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.1 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 327 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  27.97 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 362 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 		 366 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.97 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  27.87 
 
 		 362 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  30.23 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  28.15 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.47 
 
 		 471 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  28.19 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 470 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  27.73 
 
 		 366 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  28.39 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  28.63 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.45 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.97 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  29.66 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.54 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  28.77 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  29.68 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  27.48 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  27.97 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  27.97 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  29.66 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  29.24 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  28.25 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  28.03 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  28.38 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  29.87 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  28.15 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.3 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  26.91 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.53 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  27.65 
 
 		 470 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  27.57 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  26.69 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  27.09 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>