More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6367 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  100 
 
 		 441 aa  867    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  77.47 
 
 		 447 aa  631  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  78.47 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  76.96 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  68.29 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  69.12 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  71.97 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  68.17 
 
 		 521 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  68.17 
 
 		 520 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  67.93 
 
 		 518 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  68.17 
 
 		 565 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  67.93 
 
 		 518 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  68.41 
 
 		 517 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  68.41 
 
 		 563 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  69.36 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  68.45 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  68.45 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  68.45 
 
 		 576 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  69.36 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  68.45 
 
 		 560 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  68.45 
 
 		 576 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  58.03 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  58.03 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  45.22 
 
 		 440 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  42.47 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  45.43 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  43.51 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  43.05 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  43.75 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  45.56 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.49 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  42.32 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  41.8 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  42.2 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  41.47 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  39.6 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  40.18 
 
 		 490 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  42.19 
 
 		 485 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  41.53 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  43.75 
 
 		 523 aa  256  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  41.98 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  42.15 
 
 		 442 aa  253  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  40.18 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  41.45 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  41.15 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  42.44 
 
 		 441 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  40.57 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  40.71 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  41.53 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  41.31 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  41.65 
 
 		 445 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  41.59 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.14 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  42.02 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  42.33 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  42.44 
 
 		 437 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  40.5 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  44.3 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  38.05 
 
 		 522 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  36.95 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  36.9 
 
 		 506 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  33.11 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  34.51 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.45 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  35.6 
 
 		 859 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.07 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  28.61 
 
 		 538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  31.06 
 
 		 512 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.13 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.98 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  31.87 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.48 
 
 		 584 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.01 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.01 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.01 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  31.08 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.01 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.01 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  27.11 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  30.48 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.19 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  28.07 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  33.5 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.27 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.57 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  32.62 
 
 		 435 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  30.5 
 
 		 510 aa  99.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.97 
 
 		 606 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  30.83 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  27.2 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  28.76 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.39 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.46 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  29.46 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.46 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  33.87 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  27.86 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>