141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5718 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5718  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  100 
 
 
134 aa  269  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3173  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  42.4 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0871  heat shock protein, Hsp20 family  50.4 
 
 
134 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0996  heat shock protein Hsp20  50.4 
 
 
134 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000618844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3753  hypothetical protein  45.24 
 
 
135 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1147  molecular chaperone (small heat shock protein)-like protein  38.89 
 
 
196 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467431  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3005  hypothetical protein  40.32 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.78 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.46 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  35.96 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3336  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  29.17 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  23.97 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.36 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.48 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  30.34 
 
 
152 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  33.67 
 
 
230 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  37 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
158 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
150 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 
158 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  33.05 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1732  HSP20 family protein  37.31 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2401  heat shock protein Hsp20  34.04 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000662378  hitchhiker  0.00157329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  25.77 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  30.91 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  27.71 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  30.4 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  39.71 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0409  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  38.03 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3323  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 
228 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  30.99 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  28.72 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0672  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 
159 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000109595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  30.34 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  25.44 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  25.44 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  29.91 
 
 
145 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  25.78 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  31.52 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  25 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  30.95 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3192  HSP20 family protein  29.13 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  22.92 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  29.79 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1806  heat shock protein Hsp20  29.21 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332989  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1100  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000430897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  25.78 
 
 
189 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  25.93 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  32.63 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  26.23 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  34.43 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0296  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0617  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.23773e-35 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  29.82 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  28.71 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0603  heat shock protein Hsp20  33.8 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  28 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  29.03 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1533  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.208575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  29.35 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  24.64 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  32.95 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  32.95 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  23.58 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0859  heat shock protein Hsp20  29.47 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.340245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  30.3 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0406  heat shock protein Hsp20  31.18 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0194442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  32.22 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  28.09 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>