More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4685 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  96.36 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  83.9 
 
 		 254 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  72.92 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  72.92 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 258 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 248 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  72.49 
 
 		 248 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 240 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 248 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  59.83 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 238 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.6 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 198 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  21.6 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  21.64 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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