More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4559 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  97.67 
 
 		 301 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  91.03 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  58.8 
 
 		 304 aa  359  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  53.38 
 
 		 304 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  52.9 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  54.52 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  54.92 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  54.83 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  58.5 
 
 		 299 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  52.53 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  51.53 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  50 
 
 		 304 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  52.54 
 
 		 304 aa  301  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  49.32 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  48.31 
 
 		 304 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  49.16 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  47.14 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  47.14 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  47.14 
 
 		 306 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  46.46 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  46.8 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.8 
 
 		 390 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  48.15 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  46.13 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.13 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.13 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  46.13 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.13 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  46.46 
 
 		 305 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  46.46 
 
 		 305 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  48.29 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  46.13 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.12 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  45.97 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  45.82 
 
 		 302 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  46.18 
 
 		 304 aa  248  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  45.27 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.19 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  37.74 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  33.91 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  36.24 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  35.82 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  34.18 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.6 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  31.69 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.13 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.27 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.39 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  31.17 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.62 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.35 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  31.05 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  31.71 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  26.48 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 293 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  31.47 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>