More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1602 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1602  histidine kinase  100 
 
 		 582 aa  1144    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1760  histidine kinase  76.52 
 
 		 563 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2867  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  89.85 
 
 		 591 aa  1031    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2319  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.49 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.28 
 
 		 539 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.0899176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  40.15 
 
 		 1053 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 430 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 651 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  38.21 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  36.57 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 854 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 632 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 632 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  40.24 
 
 		 632 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3631  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 361 aa  160  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.991332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 		 627 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 887 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  36.2 
 
 		 749 aa  157  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 479 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 751 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 656 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 604 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 458 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 532 aa  150  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 1267 aa  150  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 1177 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 483 aa  150  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 510 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  27.83 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 605 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 751 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  36.96 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5954  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0760832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  33.7 
 
 		 796 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  36.7 
 
 		 733 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 713 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 396 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 704 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 762 aa  143  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 526 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 		 510 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 1669 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 1354 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 355 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 1166 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0666  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 799 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 915 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 748 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  32.21 
 
 		 564 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 756 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  34.48 
 
 		 755 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 761 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 798 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  31.58 
 
 		 703 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  32.6 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1166 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5134  histidine kinase  36.44 
 
 		 431 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 749 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 738 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 807 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0386  two component sensor kinase  26.54 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 396 aa  138  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  34.36 
 
 		 558 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  34.04 
 
 		 812 aa  138  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 583 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 723 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 1224 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 821 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 821 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 775 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1341  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 495 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0234409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 810 aa  137  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 		 821 aa  137  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 1562 aa  136  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 748 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>