More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1841 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  45.19 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  47.06 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  47.72 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  47.47 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  47.45 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  39.49 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  39.13 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.18 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.82 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2400  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.56 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.37 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  36.55 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  36.04 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.34 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  34.87 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.87 
 
 		 245 aa  88.2  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  34.87 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  27.17 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.43 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.73 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  29.26 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.43 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  31.66 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  29.06 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  29.06 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.92 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  30.65 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  33.33 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  27.18 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.29 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.41 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.45 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  29.68 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  30.57 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  33.69 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  28 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  27.41 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.15 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  28 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  28 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.55 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.92 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.92 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  26.6 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  27 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  24.64 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  26.6 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.02 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  32.45 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.47 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  33.69 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  27.8 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  24.38 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  25.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.78 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  25.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  25.13 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.06 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  25.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  23.44 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  23.44 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  23.44 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  23.44 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>